蜥蜴祖先是什么？
“祖先”这个概念在进化生物学中是个极为严格的术语，意味着一个物种起源于另一个物种。但是，正如许多其他进化论中的概念一样，“祖先”这个词的使用并不是那么严格。 如果你指的“祖先”是某一类动物的直接祖先，而不是某一物种或某一类的祖先，那这个问题就很好回答了。所有现生动物都来源于同一个古代祖先——一个生活在约5亿年前的单细胞古生物。尽管这个答案听起来可能毫无惊喜，但却是真的。
如果你指的“祖先是某一个特定的物种”，并且问的是某个特定物种（如人类）的进化史，那么这个问题的答案就要更复杂一些。因为与物种的定义一样，“祖先”也面临着种以下级别的分类单位没有稳定基因组作为遗传标记的问题。科学家们采用了多种方法来解决这个问题并得到了多个答案。一种方法是回溯物种的形态演化历史，从现存物种回溯至其形态发生明显改变的祖先类型。
例如，现代人类的Y染色体大约95%编码序列是与黑猩猩共享的，这意味着人类和黑猩猩最近的共同祖先是一个拥有现代人类男性生殖器的雄性。如果考虑到雌性的性状需要经过若干代雌性个体才能表现出形状上的微小差异，那么雌性祖先的样子就更令人费解了。另一种方法是回溯物种的分子演化历史，看看哪一个基因最先出现突变。然而，即使分子演化史提供了某一个物种的进化路径，它也并不能告诉我们这一进化路径是否经过了某个特定的点。
如果采用第三种方法，比较不同物种基因组之间的异同，我们就可以得到不同物种之间共同保存的基因片段，将这些基因片段串联起来就可以大致勾勒出各个物种的进化历史。不过，这种方法得到的只不过是我们猜测的各物种的进化枝，需要额外实验数据进行验证。